1、选购生物菌肥时，要注意生产日期，不用过期产品，一般超过生产日期1年的生物菌肥活性就会显著降低。
2、看生物菌肥有无农业部登记证，正规生产厂家的产品都应该有农业部登记证号，省农业厅不批准生物菌肥登记。所以凡是印有××省农肥登记的生物菌肥都是假冒产品，严防普通有机肥冒充生物菌肥。
3、微生物菌肥还要看活菌数量是否符合国家规定，国家规定生物菌剂有效活菌数≥2亿/克，颗粒状的≥1亿/克，符合生物肥料和生物有机肥的有效活菌数≥2000万/克。切记不合格的生物菌肥不要购买使用。
4、生物菌肥最好与经过充分腐熟的有机肥混合使用，其效果要远好于单独施用有机肥和生物菌肥。
5、生物菌肥不宜与化肥直接混合使用，这是因为化学肥料中的高浓度的化学物质对生物菌肥里的微生物有毒害作用，容易杀死菌肥里的有益菌。
6、微生物菌肥不宜与杀菌剂、杀虫剂、除草剂同时使用，也不要在使用生物菌肥后再实行土壤消毒。
7、生物菌肥适宜的土壤湿度为60%左右，所以要注意不要在过分干旱时使用。
8、生物菌肥对于阳光中的紫外线敏感，不宜采用地表撒施，可以在阴天或清晨、傍晚于土壤中施用。
9、生物菌肥施入土壤后，有一个菌群繁殖壮大的过程，因此，在果树根系开始生长前使用。
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